丟失增值稅專用發票的情況下，一般不會罰款（kuǎn）的，但超過90天就不能抵（dǐ）扣進項稅額了，可價稅合計記入庫存商品成本。增值稅是以商品(含應稅勞務（wù）)在流轉（zhuǎn）過程中產生的增值額（é）作為計稅依據而（ér）征（zhēng）收的一種流轉稅。從計稅原理上說，增（zēng）值稅是（shì）對商品生產、流通、勞務服務中多個環節的新增價值或商品的附加值征收的一種流轉稅。實行價外稅，也就是由消費者負擔，有增值才征稅沒（méi）增值不征稅。
1、銷售方丟失增值稅（shuì）專用發票
(1)丟失（shī）空白未開具的增值稅專用發票的，首先按規定程序（xù）向銷售方當地主管（guǎn）稅務機關（guān）、公安機關報失（shī），接（jiē）受稅務機關處罰;其次，由主管稅務機關代收取“掛失登報費”，並將丟失專用發票的納稅人名稱、發票份數、字軌號碼、蓋章與否（fǒu）等（děng）情況，統一傳(寄)中國稅務報社等稅（shuì）務（wù）報刊雜誌上刊登“遺（yí）失聲明（míng）”。
(2)銷（xiāo）售方丟失（shī）已開具專（zhuān）用發票的發票聯和抵扣聯（lián）的，待申報、報稅後向主管稅務機關（guān）申請出具《丟（diū）失增值稅專用發票已報稅證明單》，並把該證明和丟失發票的記賬（zhàng）聯複印件交購買方抵扣。
(3)銷（xiāo）售方丟失已開具專用發票（piào）的抵扣聯（lián）、發票聯其中一聯(兩（liǎng）聯（lián）沒有全部（bù）丟失)的：可讓（ràng）購買（mǎi）方使用未丟（diū）的聯次到主管稅務機關認證和記賬，複印件留存備查。
2、購貨方丟（diū）失增值稅專用發票
(1)如果丟失（shī）前已（yǐ）認（rèn）證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用（yòng）發（fā）票記（jì）賬聯複印件（jiàn）及銷（xiāo）售方所在地（dì）主管稅務機關出具（jù）的《丟失增值（zhí）稅專用發票已報稅證明單》，經購買（mǎi）方主管稅務機（jī）關（guān）審核同意後，可作（zuò）為增值稅進項稅額的抵扣憑證。
(2)如果丟失前未認證的，購買方憑銷售（shòu）方提供的相（xiàng）應專用發票記賬聯複印件到（dào）主管（guǎn）稅務（wù）機關（guān）進行認證，認（rèn）證相符的憑該專用發（fā）票記賬（zhàng）聯複印件及銷售方所在地主（zhǔ）管稅務（wù）機關出具的《丟失增值稅專用發票已報（bào）稅證明（míng）單》，經購買方主管稅務機關審核同意（yì）後，可作為（wéi）增值稅進項稅額的抵扣（kòu）憑證。
增值（zhí）稅專用發票丟失的情況下，是可以到稅務機關重新開取的，但一般情況下需要對舊發票進行注銷，再進行合法的開具。當事人可以根據稅務（wù）行（háng）政機關的要求，提交個人的相關信（xìn）息（xī）或者（zhě）發票的抬頭信息，並說明丟失的相關情況，稅務（wù）機關（guān）在審查通過後就可以（yǐ）進行補開發票。
稅收行政訴訟的並（bìng）原則是首先需要經過行政複議前置才能夠提起（qǐ）行政訴訟。稅務保全措（cuò）施是由稅務機關作出的，當事（shì）人對保全措施有異議的（de），可以申（shēn）請行政複議（yì）維護自（zì）己權益（yì）。
《中華人民共和國稅（shuì）收征收管理法》
第八條 納稅人、扣繳義務人有權向稅務機關了解國家稅收法律、行政法規的規定以及與納稅程序有關的情況。
納稅人、扣繳義務人有權要求稅務（wù）機關為納稅人、扣（kòu）繳義務人的情況保密。稅務機（jī）關應當依法（fǎ）為納稅人、扣繳（jiǎo）義務人（rén）的情況保密。
納稅人依法享有申請減稅、免稅（shuì）、退稅的權利。
納稅人、扣繳義（yì）務（wù）人對稅務機關所作出的決定，享有陳述權、申辯權（quán）;依法享有申請行政複議、提起行政訴訟、請求國家賠償（cháng）等權利（lì）。
納稅人、扣繳義（yì）務人有（yǒu）權控告和檢舉稅務機關、稅務人（rén）員的違法違紀（jì）行為（wéi）。
第八十（shí）八條納稅人、扣繳義（yì）務人、納稅擔保人同稅務機關在納稅上發（fā）生爭議時，必須先依照稅務機關的納稅決定繳納或者解繳稅款及滯納金或者提供相應的擔（dān）保，然後可以依法（fǎ）申請行政複議（yì）;對行政（zhèng）複議決定不服的，可以依法向人民法院起訴。
當事人對稅務機（jī）關的（de）處罰決定、強（qiáng）製（zhì）執行措施（shī）或者稅（shuì）收保全措施不服的，可以依法申請行政複議，也可以依法向人民法院起訴。
當事人對稅務機關的處罰決定逾期不申請行政複（fù）議也不向人民法院起訴、又不履行（háng）的，作出處罰決定的稅務機關可以采取本法第四十條規定的強製執行措（cuò）施，或者申請人民法院強製執行（háng）。
當事人對稅務機關的處罰決（jué）定（dìng）、強製執行措施或者（zhě）稅收保全措施（shī）不服的，當事人有（yǒu）自由選擇權，可以要（yào）求稅務行政複議，也可以直接提起稅務行政訴訟。
當事人對稅務機關的（de）處罰決（jué）定逾期不申請行政複議也不向人民法院起訴、又不履行的，作出處罰決定的稅務機關可以采取本（běn）法第四十條規定的（de）強製執行措施，或者申請人民法院強製執行。
日（rì）常生活當中隻要是涉及到行政具體行為方麵的都是可以提出異議的，並且可以采取一定的方式來救濟自己（jǐ）的權利，最常見的就是（shì）提出行政複議或者是行政訴訟，而稅收方麵（miàn）的是需要先提出行政複議再提出行政訴訟。
